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  • 名称: Metagenomic DNA Isolation Kit for Water
  • 货号: MGD08420
  • 单位: 20 Purif.
  • 产品FAQ信息:
  • 浏览次数: 362

Metagenomic DNA Isolation Kit for Water

水样宏基因组DNA提取试剂盒

应用:

  • 从水中简单分离用于fosmid克隆的微生物宏基因组DNA,包括一些革兰氏阳性菌。
  • 分离的宏基因组DNA可用于PCR反应及测序。

适于水样品的宏基因组DNA提取试剂盒是为了从水样品中直接提取可培养及未培养的微生物的宏基因组DNA.用于产生随机的fosmid文库克隆。传统分离用于构建fosmid文库的DNA方法包括脉冲电泳和随机剪切,在连接fosmid载体构建文库前,还要通过脉冲电泳对片段大小进行选择。这些方法(图1B)一般耗时,低效,而且产生的文库基因组覆盖度低。水样宏基因组DNA提取试剂盒可分离高分子量DNA,这些DNA通常是随机进行剪切的(片段大小一般40kb),不需要进行片段的选择(图1A,并且可以直接用于Epicentre pCC1FOS™ Vector (CopyControl™ Fosmid Library Production Kit,单独出售)

该盒子操作中,在蛋白酶K处理后使用了Ready-Lyse™裂解酶分离高分子量DNA.使用这个盒子,从300ml湖水中提取的DNA构建fosmid文库,得到100000个克隆。

好处:

  • 无需玻璃珠震荡。
  • 不需要脉冲电泳,机械剪切及片段大小的选择。
  • 减少DNA损失,因而减少了文库覆盖度不够的问题。
  • 不需要柱子或苯酚、氯仿提取。
  • 90分钟内完成用于Fosmid文库的DNA提取(图2)
  • 增加了环境样品中低丰度微生物基因组DNA的收集可能性及产量
  •  

图2插入宏基因组fosmid文库的片段大小。从湖水样品中分离宏基因组DNA,用CopyControl™ Fosmid文库构建试剂盒构建文库。从随机选择的克隆中分离DNA,用NotI酶切,插入片段大约40kb。泳道M, Kilobase ladder; 泳道1, 40-kb 对照片段; lanes 2-19,NotI 消化的fosmid DNA.

图1. 比较传统方法与Epicentre的方法对于宏基因组DNA的分离和文库构建.


货号     规格
Metagenomic DNA Isolation Kit for Water
MGD08420 20 Purifications
Contents: Filter Wash Buffer, Meta-Lysis Solution (2X), MPC Protein Precipitation Reagent, Proteinase K, Fosmid Control DNA, RNase A, Ready-Lyse™ Lysozyme Solution, TE Buffer.
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