新一代测序技术--NGS的工作原理和功能
发布时间:
2018-12-27 09:59
欢迎了解新一代测序
凭借前所未有的通量、扩展性和速度,新一代测序(NGS)让生物系统的研究也到了前所未有的境界。
传统的DNA测序技术已不能满足当今复杂的基因组研究问题对信息深度的需求。新一代测序弥补了这一空缺,成为了解决这类问题的常用研究工具。
新一代测序能为您带来
创新的新一代测序样本制备和数据分析选项可用于各类应用。例如,新一代测序能使您:
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快速对全基因组进行测序
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放大查看深度测序的目标区域
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利用RNA测序(RNA-Seq)来发现全新的RNA变异和剪接部位,或者在基因表达分析中准确定量mRNA。
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分析表观遗传学因素,例如全基因组DNA甲基化和蛋白质-DNA相互作用
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对癌症样本进行测序,研究稀有体细胞变异、肿瘤亚克隆等
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研究人类的微生物多样性
新一代测序能为您带来
创新的新一代测序样本制备和数据分析选项可用于各类应用。例如,新一代测序能使您:
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快速对全基因组进行测序
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放大查看深度测序的目标区域
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利用RNA测序(RNA-Seq)来发现全新的RNA变异和剪接部位,或者在基因表达分析中准确定量mRNA。
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分析表观遗传学因素,例如全基因组DNA甲基化和蛋白质-DNA相互作用
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对癌症样本进行测序,研究稀有体细胞变异、肿瘤亚克隆等
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研究人类的微生物多样性
可实现全基因组测序
人类基因组计划使用毛细管电泳进行桑格测序,耗时10年,花费近30亿美元。
相比之下,新一代测序让普通人员也能进行大规模全基因组测序。
表达图谱的无限动态范围
NGS让基于序列的基因表达分析从模拟技术过渡到“数字化”技术。这样,您可以利用芯片的宽度和qPCR的分辨率定量分析RNA表达。
芯片基因表达测量的局限在于低端的噪音和高端的信号饱和。相比之下,新一代测序通过离散的定量以及数字化的测序read读数,提供了近乎无限的动态范围。
靶向新一代测序的调谐分辨率
新一代测序具有高度扩展性,您可根据特定的实验需求调谐分辨率水平。
靶向测序让您的研究聚焦于基因组的具体区域。选择是要对多个样本做浅扫描,还是要减少样本数量提高测序深度以期在指定区域找到稀有变异。
Illumina新一代测序的工作原理
Illumina新一代测序利用了与经典的桑格链终止法完全不同的方法。这种方法使用了边合成边测序(SBS)技术,进行DNA链复制时追踪检测掺入的标记核苷酸,支持大规模平行测序方式。
新一代测序产生大量的DNA序列数据,比桑格测序预计得到的数据更丰富、更完整。Illumina测序系统单次运行可以输出的数据范围从30万碱基到数万亿碱基,取决于仪器类型和配置。
Illumina新一代测序的最新进展
Illumina新一代测序技术的最新突破性进展包括:
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双通道SBS:该技术的测序速度比旧版本的SBS技术更快,但仍然保持了相同的高数据准确性。
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图案化流动槽技术:为多种测序应用提供了优秀的通量水平
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多至6万亿碱基(Tb):了解NovaSeq 6000系统如何在2天内提供多至6 Tb的可调输出*。
*显示的规格基于尚未发布的S4流动槽双流动槽运行,因此将来性能会有变化。
将新一代测序应用到您的实验室
下述资源为正在考虑购买NGS系统的研究人员提供了宝贵的指南。
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