ScriptMiner™ Small RNA-Seq Library Preparation Kit (SinglePlex; Illumina-compatible)

ScriptMiner™ Small RNA-Seq Library Preparation Kit (SinglePlex; Illumina-compatible)


货号

SMSP10908


规格

8 Rxns


存储温度

-20℃


产品详情


ScriptMiner™ Small RNA-Seq Library Preparation Kit  (2013.12.30 已停产)

(小RNA测序文库制备试剂盒)

ScriptMiner™ Small RNA-Seq Library Preparation Kit 可利用小RNA(包括miRNA)制备不加条形码(单项样品)或含有条形码(多项)样品的RNA测序文库。试剂盒中含有烟草酸性焦磷酸化酶,可以捕获含有 帽子的RNA和小5'-三磷酸化的RNA(图1ScriptMiner过程是一个独特的酶促过程,可去除导致接头二聚体形成的多余的接头寡聚物,因此大大减少了测序文库中接头二聚体产物的量。

 

*专利申请中。

  • miRNA的制备小RNA测序文库,包括植物miRNA和任意的5'-帽子结构的RNA5'-三磷酸化的RNA(图2)。
  • 大大降低了测序文库接头二聚体产物量。
  • RNA的链特异标记可使文库定向测序。
  • 为期一天的过程。
  • RNA1-5微克)或大小选择的RNA100pg)可以用来作为原料。
  • 整合了Illumina®标签读数(Epicentre单独提供)或使用者定义的条形码(用户提供)

ScriptMiner库与Illumina公司®TruSeq®Clusterkits和用于Illumina® GAII and HiSeq测序仪的测序引物兼容。

1(点击放大)。ScriptMiner™文库可以在1天内制备完成,可从miRNA和任意的5'-帽子结构的RNA5'-三磷酸化的RNA制备文库。 ScriptMiner库是使用标准的Illumina公司®测序引物测序

 

 

2(点击放大)。该ScriptMiner程序包括一个TAP可以捕获含有 帽子的RNA和小5'-三磷酸化的RNA)的选择处理过程。

一个ScriptMiner™ RNA测序文库的制备使用TAP处理捕获小RNA(如图阴影所示),在没有TAP处理制备的文库中则检测不到

另请参阅表1

RNA Sample

Enzyme Treatment

Reads passing filter

Reads aligned to hg19

% reads aligned

BrRR

TAP

1,384,314

1,380,799

99.75%

BrRR

No TAP

712,841

711,926

99.87%

HeLa

TAP

1,560,105

1,555,406

99.70%

HeLa

No TAP

662,365

661,362

99.85%

 

1 总结了有无TAP处理的ScriptMiner 文库的测序数据

含有TAP处理的ScriptMiner 文库捕获了整个小RNA的转录组,未经过TAP处理的文库只捕获了单磷酸化的小RNA,与未经TAP处理的文库相比,处理后的产生至少两倍以上的均衡有效读数。BrRR,人脑相关RNA; HeLa, RNA

 

Catalog No. Size

ScriptMiner™ Small RNA-Seq Library Preparation Kit (SinglePlex; Illumina-compatible)
SMSP10908 8 Reactions

ScriptMiner™ Small RNA-Seq Library Preparation Kit (MultiPlex; Illumina-compatible)
SMMP101212 12 Reactions

RNA-Seq Barcode Primers (Illumina-compatible)
RSBC10948 48 Reactions