应用
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回收琼脂糖凝胶核酸用于:限制酶图谱; 克隆; 标签; DNA测序;转化YAC, BAC,粘粒,fosmid,和质粒载体; 显微注射;和扩增反应。
GELase™ Agarose Gel-Digesting Preparation 含有一个独特的epicentre β- 琼脂糖消化酶,可简单,保证质量的从低熔点琼脂糖凝胶中回收完整的DNA 或RNA. 无论电泳缓冲液是TAE,TBE,MOPS或磷酸缓冲液等。胶可以直接在电泳缓冲液中融化也可以在电泳缓冲液中加入溶胶酶buffer或直接在溶胶酶buffer中溶胶,这样溶胶酶活性会更高。
溶胶酶可溶解琼脂糖的碳骨架,释放小分子量,可溶的寡糖分子。消化的胶溶液中DNA用醋酸氨沉淀或乙醇沉淀。胶消化产物是乙醇可溶的。
好处:
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DNA或RNA的回收率接近100% (图1).
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纯化大片段DNA或RNA,如上兆的碱基,可保证完整的生物活性。
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简单,灵活的操作,减少操作时间。
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典型的TAE溶解的200毫克的胶,用3个单位GELase在不到10分钟内就可被消化。
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比其他凝胶消化酶活性更强。
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比离心柱或其他凝胶消化的方法更经济。
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提供两种便捷的包装:1 U /μL的标准反应和0.2 U /μL包装适用于小的凝胶样品,比较经济,但需要延长消化时间。
单位定义:一个 单位的GELase 定义为45°C 条件下,GELase Buffer中1小时内制备600mg溶解在1% LMP琼脂糖凝胶DNA所需要的酶量。
储存 Buffer: 50% glycerol含有50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 0.1 mM EDTA, 0.1 M NaCl, 0.1% Triton X-100, and 1 mM DTT.
质量控制:每批GELase制备液中未检测到 DNA核酸外切酶,核酸内切酶,核糖核酸酶的活性。
注意:
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一个单位GELase制备液等于3个或更多个单位的大多数其他凝胶消化酶。
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我们建议添加乙酸铵对核酸沉淀,因为不是由乙酸铵的存在下用乙醇沉淀GELase制备液和大多数其它蛋白。而是所述的消化产物中的寡糖,在乙酸铵的存在下在乙醇中溶解度较高。为了您的方便,提供您5 M醋酸铵溶液,可随时使用。
参考文献
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Kirkpatrick, H.A. et al. (1997) Epicentre Forum 4(3), 11.
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Sasaki, H. and Hogan, B.L. (1994) Cell 76, 103.
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Schedl, A. et al. (1993) Nature 362, 258.
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Woo, S.S. et al. (1994) Nucleic Acids Res. 22, 4922.
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Steck, T.R. (1994) BioTechniques 17, 676.
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Chen, L. et al. (1994) BioTechniques 16, 228.
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图1,使用GELase™ Gel-Digesting Preparation 回收任何大小的DNA,回收率接近100%。实验1,DNA大小从63 bp到7.9 kb,用1.5%琼脂糖胶分离(A1),用GELase回收后再使用1.5%琼脂糖胶分析,EB染色(B1)。实验2,高分子量的大豆DNA用1% LMP-琼脂糖胶通过脉冲场电泳分离(A2)。2.2 Mb DNA条带通过溶胶酶纯化并通过1%琼脂糖胶分析,EB染色(B2).
Units of GELase™ Preparation
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Digestion Time
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3.0
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8 min
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2.0
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15 min
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1.0
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30 min
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0.33
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60 min
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表1. 消化TAEbuffer溶解的200毫克1%LMP琼脂糖所需要的时间 。

图2 . GELase 操作流程是简便,弹性的,可提供最大的活性和最快的操作速度。
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